«Нефтчи» дебютировал в Лиге Конференций в дебютном сезоне турнира. Наша команда, начавшая сезон 2021/2022 в Лиге Чемпионов, прошла первый этап, но проиграла во втором этапе и вышла в третий этап Лиги Европы, где проиграла и попала в плей-офф Лиги Конференций. «Черно-белые», которые в первой игре против израильского клуба «Маккаби» (Хайфа) вели со счетом 3:1, в итоге упустили победу (3:3), а в ответной игре потерпели поражение с крупным счетом – 0:4. 

Нефтчи» начал сезон 2022/2023 со второго этапа Лиги Конференций. По итогам двух игр (0:2, 3:0) «черно-белые», обыгравшие кипрский клуб «Арис», не смогли одолеть австрийский «Рапид» – 2:1, 0:2.

Всего «Нефтчи» провел в Лиге Конференций 6 матчей. Наша команда выиграла 2 из них и проиграла 3 раза. В 1 матче зафиксирована ничья. Разница мячей – 8-12.